三法印同时也是佛教与在其之前的婆罗门教，以及其他宗教所较不同之处。佛教许多方面承袭或相似于婆罗门教，如禅定、苦行等，但三法印即是佛教与婆罗门教的不同处，三法印为佛教自身所创。

此外，三法印也是佛教的核心价值，与其他宗教不同的，佛教允许在谨守三法印的价值与教义上，对其他方面进行方便性变动、改变、变化，即是不违反三法印，可以用各种方式传教、修行，包括用密法加速修行(如密宗)，也因此使佛教富於变化与多样性，相对的有部分宗教对于教义、教规、教条、传法、授法、修法等有著较严格的坚守性，不允许任意或随时地需求而变异。